Penelitian menjadi aspek penting yang harus dilakukan oleh dosen sebagai perwujudan dari Tri dharma perguruan tinggi. Tradisi penelitian di IAIN Tulungagung sesungguhnya sudah terbangun secara baik dan terus dikembangkan agar hasilnya maksimal. salah satu caranya adalah dengan membangun jaringan penelitian dengan lembaga-lembaga penelitian lainnya.
Pusat penelitian dan penerbitan IAIN Tulungagung berupaya membangun komunikasi dan kerjasama dengan berbagai pusat penelitian dari perguruan tinggi lainnya. Juga membangun kerjasama dengan Puslitbang Kemenag RI Jakarta dan LIPI. Cara ini diharapkan mampu memperkuat basis tradisi penelitian bagi dosen-dosen IAIN Tulunaggung, termasuk dosen Pascasarjana.
Jaringan penelitian yang dikembangkan oleh pusat penelitian dan penerbitan IAIN Tulungagung ada beberapa bentuk:
1. Pusat penelitian dan penerbitan IAIN Tulungagung masuk sebagai anggota Pusat Jaringan Penelitian (Pusjarlit) yang dikoordinasi oleh Kementerian Agama RI.
2. Pusat penelitian dan penerbitan IAIN Tulungagung mengembangkan jaringan penelitian dengan berbagai perguruan tinggi di Indonesia: STAIN Kediri, STAIN Ponorogo, UIN Sunan Ampel Surabaya, UIN Maliki Malang, Universitas Muhammadiyah Malang, Universitas Brawijaya Malang, Universitas Negeri Surabaya, dan beberapa universitas lainnya.
3. Jaringan penelitian juga terbangun dengan pusat penelitian dan pengembangan (Puslitbang) Kemenag RI dan berkomunikasi aktif dengan salah satu peneliti Puslitbang Kemenag, yaitu Prof. Dr. Koeswinarno, M.Si.
4. Jaringan penelitian dengan Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) diwujudkan dalam berbagai bentuk, diantaranya pelatihan penelitian, dimana dosen IAIN TUlungagung dilatih penelitian oleh para peneliti LIPI, dan salah satunya Prof. Anas Saidi, MA
5. Jaringan penelitian dengan berbagai instansi lain, seperti pemerintah kabupaten Tulungagung, Trenggalek, Kediri dan beberapa pemerintah lainnya.
Pengembangan penelitian masih terus dilakukan secara intensif agar tradisi penelitian di lingkungan IAIN Tulungagung semakin berkembang secara intensif.